43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2262 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  69.08 
 
 		 155 aa  217  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  55.92 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  53.69 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  54.11 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  54.25 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  49.36 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  50.69 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  47.62 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  48.32 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  55.47 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 		 324 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 333 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 324 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>