37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2993 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  59.87 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  59.06 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  57.5 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  56.38 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  57.86 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  53.29 
 
 		 166 aa  157  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  52.23 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 324 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  53.69 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44.97 
 
 		 172 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  42.38 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>