85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2044 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  100 
 
 
160 aa  323  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 
155 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  58.17 
 
 
160 aa  170  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  54.05 
 
 
166 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  56.95 
 
 
153 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
153 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 
162 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
164 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 
155 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
155 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
157 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
157 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
157 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  56.2 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  54.55 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  52 
 
 
155 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  51.59 
 
 
154 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 
174 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 
162 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  49.67 
 
 
172 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  55.13 
 
 
156 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
163 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 
155 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 
154 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
154 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 
324 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 
154 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
166 aa  101  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  24.65 
 
 
141 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  37.37 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  30.63 
 
 
336 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 
314 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.45 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
324 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
303 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
333 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  28.38 
 
 
325 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.9 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.9 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  35.2 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
351 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.9 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.9 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  34.48 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  34.48 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
195 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
322 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  28.48 
 
 
308 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.31 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
211 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  27.1 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
301 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.48 
 
 
193 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
216 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>