66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1884 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 165 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  70.3 
 
 		 166 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  73.83 
 
 		 166 aa  220  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 176 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  51.49 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  45.8 
 
 		 390 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  47.66 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  43.54 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  44.6 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.31 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  44.19 
 
 		 141 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 464 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 181 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  44.03 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 141 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 138 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  41.86 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  41.86 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 201 aa  87.8  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  41.44 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  37.72 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 246 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  35.67 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  33.78 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  37.82 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  37.04 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 299 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.34 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.07 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>