80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4258 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  49.61 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  45.19 
 
 		 390 aa  130  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 246 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  51.08 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  49.62 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  53.08 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  44.68 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  48.12 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 		 464 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  50.76 
 
 		 152 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  47.37 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  42.45 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  48.06 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  51.59 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 153 aa  101  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 149 aa  98.2  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 138 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 139 aa  90.1  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 127 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 141 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  38.46 
 
 		 134 aa  84.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  38.26 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  32.28 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  28.35 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 315 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 314 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  30.43 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 351 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.48 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  31.48 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 140 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 138 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 153 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 289 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 155 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 		 229 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>