109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1545 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  57.14 
 
 
134 aa  165  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 
156 aa  163  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  59.66 
 
 
127 aa  158  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  52.71 
 
 
136 aa  143  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
138 aa  133  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
139 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
149 aa  87  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  43.27 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  37.39 
 
 
390 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  34.75 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
464 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  37.17 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  37.23 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  33.9 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  37.69 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
246 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.14 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  30.83 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  42 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  42 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  42 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.09 
 
 
195 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  31.67 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
536 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
195 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  35 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  34.38 
 
 
416 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  46 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  38 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  38 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  40 
 
 
198 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  38 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  38 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  31.86 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  31.33 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  38 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  36 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  38 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  47.5 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
228 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  28.95 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>