56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3446 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  100 
 
 
464 aa  879    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
170 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  57.25 
 
 
170 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
152 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  59.23 
 
 
163 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 
152 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 
163 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 
152 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  56.92 
 
 
144 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  53.79 
 
 
155 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
161 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  47.33 
 
 
390 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  53.85 
 
 
159 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
176 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 
176 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  45 
 
 
166 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
175 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  45 
 
 
166 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
168 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  44.27 
 
 
141 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
246 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
156 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.31 
 
 
162 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
155 aa  99.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
139 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
138 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 
162 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
162 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  41.84 
 
 
162 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
136 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
149 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  41.35 
 
 
178 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 
190 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
164 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
156 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
177 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  40 
 
 
141 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  42.48 
 
 
151 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
138 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  40 
 
 
141 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
156 aa  85.1  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
201 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
153 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  40 
 
 
127 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
175 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  44.83 
 
 
134 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
137 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  35.48 
 
 
159 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
149 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  25.76 
 
 
142 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
150 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  32.2 
 
 
170 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>