81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0635 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  55.3 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 168 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.21 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  47.83 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  44.6 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 		 176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  48.53 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  42.36 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  42.36 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  48.84 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  36.23 
 
 		 178 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  42.06 
 
 		 390 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 201 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  42.24 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 177 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 138 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  37.27 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  36.94 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  29.86 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  33.93 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 398 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  35.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01737  MutT/nudix family protein  40.35 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  33.82 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 136 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  33 
 
 		 424 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  37.66 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>