127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0924 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  282  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  73.08 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  73.23 
 
 
127 aa  205  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  68.18 
 
 
134 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 
136 aa  156  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
138 aa  147  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  51.94 
 
 
151 aa  146  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
139 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  36.09 
 
 
390 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
201 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  37.84 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  35.65 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  35.65 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  48.15 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  40 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
190 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  34.17 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  40.54 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.51 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
246 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  29.57 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  40 
 
 
183 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  33.33 
 
 
416 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
536 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  30.25 
 
 
178 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  40 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
209 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 
207 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  25.36 
 
 
314 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  40 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  26.42 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
201 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  42 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
180 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  37.21 
 
 
204 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  40 
 
 
198 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
181 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  40 
 
 
181 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.2 
 
 
430 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  40 
 
 
198 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  46.88 
 
 
258 aa  41.2  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  37.04 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>