50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1786 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 170 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  42.99 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  41.9 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  42.73 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  34.09 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  38.21 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  41.09 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.54 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 246 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 464 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  34.68 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  35.83 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  34.74 
 
 		 312 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  35 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  29.84 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>