76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2073 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  72.66 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  72.66 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  70.5 
 
 		 152 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  72.93 
 
 		 163 aa  172  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  69.63 
 
 		 170 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 170 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  51.22 
 
 		 390 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  53.08 
 
 		 181 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  56.92 
 
 		 464 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  50.78 
 
 		 175 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 		 168 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  45.8 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  43.61 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  53.03 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 246 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  39.85 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  47.73 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  45.74 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 175 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  39.55 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 201 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  37.21 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  36.22 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  27.64 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 209 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  27.78 
 
 		 159 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  29.32 
 
 		 287 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  40.74 
 
 		 142 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  25.83 
 
 		 179 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  35.9 
 
 		 416 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  36.25 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 351 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 333 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 205 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 153 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>