More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0763 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  312  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  93.46 
 
 		 153 aa  294  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  74.34 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  57.93 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  57.93 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  57.93 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  57.24 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  57.24 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  57.24 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  57.24 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  57.34 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  58.57 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  57.14 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1828  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.714922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  43.33 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  40.68 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  25.69 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 340 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  28.36 
 
 		 255 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.75 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2241  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 		 202 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0585336  normal  0.241237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.93 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.69 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  40.74 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  40.74 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.93 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  43.55 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  24.59 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.29 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  24.59 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  25.58 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  25.21 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.58 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.58 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  25.89 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  33.08 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  29.23 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  23.36 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.29 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  30.56 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  39.13 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 398 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>