More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0922 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  99.36 
 
 		 156 aa  314  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 		 156 aa  290  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  87.82 
 
 		 156 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  85.9 
 
 		 167 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  79.87 
 
 		 158 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 157 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  67.81 
 
 		 149 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  66.22 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 		 152 aa  207  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  55.1 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  36.67 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.05 
 
 		 399 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.86 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.47 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.5 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2110  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.95 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.326827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  28.33 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  36.56 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.41 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  28.81 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.5 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.78 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.51 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5146  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.51 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.17 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  43.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  31.34 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.44 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.17 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.046247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0556  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000501582  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.08 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.29 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  28.03 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0104  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.640787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5053  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.81 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  34.94 
 
 		 524 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0586  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0927743  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.81 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.47 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.81 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  24.81 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.81 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>