More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1651 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 216 aa  175  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  44.56 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  95.1  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  44 
 
 		 255 aa  85.1  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  29.77 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  33.65 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.38 
 
 		 430 aa  54.7  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.2 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  44.44 
 
 		 888 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 296 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 324 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 303 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 152 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 322 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  26.45 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 351 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  34.78 
 
 		 343 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 310 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.64 
 
 		 396 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  25 
 
 		 383 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 133 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 302 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 152 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35 
 
 		 424 aa  48.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  26.76 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 153 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  28.15 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.94 
 
 		 360 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  24.75 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  35.9 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  32.86 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>