138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2125 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  67.61 
 
 		 142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  67.38 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  67.42 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  49.63 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.73 
 
 		 583 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 577 aa  54.3  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  32.52 
 
 		 313 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 322 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 293 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  28.38 
 
 		 317 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 302 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.84 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  33.65 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 324 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  34.48 
 
 		 360 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  44.83 
 
 		 343 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2018  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.96 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  41.51 
 
 		 888 aa  42.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2577  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 311 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  22.44 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  24.26 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  33.09 
 
 		 314 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  30.84 
 
 		 149 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 311 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 311 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  22.93 
 
 		 176 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 161 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  40.26 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 272 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  43.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.68 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  23.68 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  23.68 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>