134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2635 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 144 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 156 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 151 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 583 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 146 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  37.21 
 
 		 160 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 139 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.17 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 143 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2930  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 167 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.36611  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 165 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 156 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  63.16 
 
 		 175 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  35.61 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  40.86 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  32.56 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 142 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  32.56 
 
 		 160 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  32.56 
 
 		 160 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  32.56 
 
 		 160 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 536 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 148 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 141 aa  47  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 128 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 140 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 141 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  40.3 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  52.5 
 
 		 208 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.54 
 
 		 170 aa  46.2  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 167 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.85 
 
 		 577 aa  45.8  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 143 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 141 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  41.94 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  35.29 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.38 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  32.28 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  44.07 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2310  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.63 
 
 		 173 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 164 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 		 160 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 		 160 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.26 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0396  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 188 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  0.770982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32.28 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 171 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.32 
 
 		 159 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  47.37 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30.07 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 124 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 145 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  43.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 140 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 145 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 145 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>