167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2356 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  100 
 
 
134 aa  262  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  75.19 
 
 
141 aa  209  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  73.28 
 
 
142 aa  199  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  67.42 
 
 
143 aa  187  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
139 aa  104  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  49.17 
 
 
146 aa  104  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
583 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
314 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  35.58 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
293 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
322 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
143 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 
146 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.36 
 
 
360 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
270 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  38.46 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.94 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.94 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.94 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
302 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.94 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.96 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  30.63 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
272 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  28.24 
 
 
888 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
282 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.69 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  33.71 
 
 
313 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  49.02 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  28.46 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3846  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.1 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.36 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.31 
 
 
171 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 
346 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 
346 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 
346 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1786  MutT/nudix family protein  35.56 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  35.53 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.04 
 
 
577 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0427  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.56 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.751341  normal  0.0128679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  26.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  26.77 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  26.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  26.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  26.77 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>