More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4495 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  66.24 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  69.06 
 
 		 206 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  65.1 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  64.71 
 
 		 182 aa  186  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  63.7 
 
 		 174 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  61.94 
 
 		 203 aa  171  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 219 aa  170  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  59.31 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  55.07 
 
 		 430 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  49.07 
 
 		 258 aa  152  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 		 282 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 272 aa  140  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 268 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  59.85 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  51.35 
 
 		 248 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 302 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  53.44 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 141 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 		 583 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.64 
 
 		 424 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.82 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  32.11 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  34.74 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 536 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.62 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  33.67 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 299 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.9 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.9 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.9 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 311 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 311 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 311 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.3 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3779  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  38.33 
 
 		 395 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>