156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2333 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  100 
 
 
143 aa  293  6e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
140 aa  128  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
139 aa  126  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
146 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 
139 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
139 aa  100  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
583 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  32.87 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  30.71 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.25 
 
 
169 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.09 
 
 
203 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
270 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
270 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
270 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.81 
 
 
577 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  31.5 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  34.91 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  29.69 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  33.57 
 
 
248 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
272 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
536 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
302 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  32.33 
 
 
313 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.9 
 
 
424 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
161 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  30 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  27.68 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  27.68 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  27.07 
 
 
258 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  25.76 
 
 
430 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32 
 
 
310 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
293 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.66 
 
 
305 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
229 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
156 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  26.98 
 
 
145 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  26.98 
 
 
145 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
356 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  26.98 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  23.19 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  50 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
194 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  39.73 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
315 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  45.28 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  45.28 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  27.64 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  30.08 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  26.19 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  25.56 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>