111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05631 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  314  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  78.81 
 
 
152 aa  259  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  57.25 
 
 
150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
158 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
171 aa  94.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  26.09 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0166  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 
172 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  32.69 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
233 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 
145 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  33 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 
365 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  23.15 
 
 
577 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  28.1 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  31.9 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  27.61 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  33.62 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  33.62 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  32.67 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  28.91 
 
 
396 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  36.52 
 
 
365 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  36.52 
 
 
365 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  30.91 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
252 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  43.14 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  30 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  28.15 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  27.73 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  29.66 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0593331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0998  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.69 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  25.96 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  43.4 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
135 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
169 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
135 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
163 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
155 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.41 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
155 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
583 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
169 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
135 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 
169 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  35.04 
 
 
135 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.64 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
252 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0544  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.788518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.06 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  28.81 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  31.62 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  27.59 
 
 
368 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>