124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1472 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  61.59 
 
 
152 aa  185  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  57.25 
 
 
150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
158 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 
171 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  30.89 
 
 
365 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  27.83 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.61 
 
 
365 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.61 
 
 
365 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0166  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  32.26 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  25 
 
 
577 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 
146 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 
150 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 
150 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 
150 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  27.27 
 
 
383 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  29.27 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  34.78 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
583 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  29.1 
 
 
396 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  28.46 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  28.46 
 
 
169 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  31.45 
 
 
147 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  27.64 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  27.64 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  27.64 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  27.64 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  27.64 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  27.64 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
293 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  31.09 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
175 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  36.07 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  25.56 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.69 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  27.18 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  30.17 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  30.17 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.69 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.08 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  29.36 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  27.69 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  28.8 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  35.25 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  28.08 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  35.96 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  33.03 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  31.15 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  35.96 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  23.85 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.04 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.69 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3077  phosphohydrolase  47.17 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.848469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  41.51 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  28.46 
 
 
147 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.53 
 
 
132 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  28.46 
 
 
147 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  28 
 
 
145 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  28.46 
 
 
147 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
162 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  29.17 
 
 
149 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.69 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2158  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  28.95 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>