194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2159 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
154 aa  316  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  89.12 
 
 
149 aa  268  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  83.67 
 
 
147 aa  253  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  82.31 
 
 
147 aa  250  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  77.24 
 
 
169 aa  236  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  78.62 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  78.62 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  78.62 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  76.55 
 
 
169 aa  236  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  76.55 
 
 
169 aa  236  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  78.62 
 
 
146 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  76.55 
 
 
150 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  76.55 
 
 
150 aa  235  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  77.93 
 
 
150 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  76.55 
 
 
150 aa  235  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  76.55 
 
 
150 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  76.55 
 
 
150 aa  235  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  76.19 
 
 
147 aa  233  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  75.69 
 
 
147 aa  228  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  75.69 
 
 
147 aa  228  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  75.69 
 
 
147 aa  228  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  72.92 
 
 
147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  72.92 
 
 
148 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  58.45 
 
 
150 aa  180  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  51.8 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  44.06 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  46.26 
 
 
159 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  46.58 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
173 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  44.93 
 
 
150 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  46.04 
 
 
157 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  44.08 
 
 
163 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  46.31 
 
 
162 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 
161 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
161 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
170 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 
127 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 
164 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  42.18 
 
 
164 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  47.86 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  44.06 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 
192 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
161 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.31 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  35.11 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  35.11 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  35.11 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  35.11 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.85 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.61 
 
 
365 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  37.4 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  37.4 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  39.53 
 
 
383 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.61 
 
 
365 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.61 
 
 
365 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2545  MutT/Nudix family protein  38.46 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2511  MutT/Nudix family protein  36.92 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25489  predicted protein  36.36 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0283789 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27463  predicted protein  36.36 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00352572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  40.82 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  29.1 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  39.22 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  30.07 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
327 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>