96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1071 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 160 aa  327  6e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  78.71 
 
 		 163 aa  244  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  67.74 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  71.62 
 
 		 148 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  66.88 
 
 		 154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  69.03 
 
 		 157 aa  208  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  67.97 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  66.44 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  66.44 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  66.44 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  66.44 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  65.13 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  65.77 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  65.77 
 
 		 164 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  65.1 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  64.43 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  64 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  63.09 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  65.79 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  62.42 
 
 		 156 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  65.99 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  63.27 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  63.27 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  63.51 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  61.49 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  60.27 
 
 		 150 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  56.05 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  60.42 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  45.39 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  41.26 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  43.54 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  43.54 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  43.54 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  44.76 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  43.54 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  44.06 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  41.45 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  42.47 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  40.79 
 
 		 169 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 		 147 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  42.66 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  41.8 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 		 149 aa  90.5  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.65 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  29.85 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  27.7 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  28.36 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  28.36 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2848  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 		 365 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  27.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  33.56 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  38.71 
 
 		 172 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  37.29 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1955  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 237 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>