87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4015 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 163 aa  330  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  78.71 
 
 		 160 aa  244  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  71.33 
 
 		 192 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  71.33 
 
 		 158 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  72.97 
 
 		 164 aa  217  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  70.78 
 
 		 171 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  71.62 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  71.62 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  71.62 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  71.62 
 
 		 164 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  70.06 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  66.88 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  70.95 
 
 		 158 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  71.43 
 
 		 148 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  64.94 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  67.57 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  67.11 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 		 156 aa  194  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  67.36 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  65.75 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  66.67 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  65.99 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  67.35 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  61.33 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  60.81 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  62.16 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  57.53 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  63.19 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  58.94 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  53.21 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  47.89 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  47.52 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  44.76 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  44.76 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  44.76 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  44.83 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  40.14 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  42.76 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  43.44 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.28 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  25.56 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.82 
 
 		 365 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.11 
 
 		 365 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.11 
 
 		 365 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  25.85 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  25.56 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  25.56 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  53.19 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 383 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>