120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2065 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  100 
 
 		 156 aa  326  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  36.3 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  34.87 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  33.08 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  32.7 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  32.58 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  34.97 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  34.27 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  34.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  34.31 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  33.08 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  36.09 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  35.37 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  35.37 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  28.86 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  28.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  28.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  34.81 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  34.81 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  34.81 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  28.19 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.03 
 
 		 365 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  36.76 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  28.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  28.19 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  30.67 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  34.82 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  32.23 
 
 		 365 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  32.23 
 
 		 365 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  34.06 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  33.06 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  29.32 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  31.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  31.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  31.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  31.65 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  31.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  32.39 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  31.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  31.94 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  26.85 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  27.52 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  26.54 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  28.19 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  28.87 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2342  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34625  normal  0.325701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  23.49 
 
 		 583 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  31.2 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  23.9 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0166  NUDIX hydrolase  27.15 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 		 147 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  31.48 
 
 		 383 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>