93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2342 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2342  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 154 aa  307  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34625  normal  0.325701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  49.3 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  49.3 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  49.3 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  48.59 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  48.59 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  48.59 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  48.59 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  47.89 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  26.49 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  32.87 
 
 		 365 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.8 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  32.87 
 
 		 365 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  27.97 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  27.97 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  27.97 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  32.37 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  32.19 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  27.14 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  27.27 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  31.03 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  35.45 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.86 
 
 		 383 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  29.6 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  28.03 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  31.88 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  28.03 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  28.03 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  28.03 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  28.03 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  28.03 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  28.28 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1399  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.373251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  27.4 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  28.03 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  25 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  29.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  25.86 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  26.89 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  29.31 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32.81 
 
 		 301 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  33.08 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  32.82 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 		 158 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  30.14 
 
 		 146 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  31.07 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>