204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0011 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  100 
 
 
144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  56.43 
 
 
141 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  55.71 
 
 
141 aa  140  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
147 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  57.36 
 
 
146 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  37.29 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  35.45 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  39 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
142 aa  52  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  59.57 
 
 
173 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
185 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
185 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  36 
 
 
210 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  60.98 
 
 
149 aa  50.1  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
322 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.1 
 
 
365 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.91 
 
 
305 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  32.43 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
341 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.04 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  34.86 
 
 
336 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  29.1 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  35.04 
 
 
365 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  35.04 
 
 
365 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  33 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2158  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
174 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.41 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  35.04 
 
 
383 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  32.26 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  32.26 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  26.79 
 
 
548 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3349  MutT/nudix family protein  38.03 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  30.65 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
303 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  72.41 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  41.38 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  27.82 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  31.58 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
190 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>