198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2034 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  81.63 
 
 
148 aa  249  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  75.86 
 
 
147 aa  236  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  75.17 
 
 
147 aa  236  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  78.47 
 
 
149 aa  235  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  72.92 
 
 
147 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 
150 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  73.94 
 
 
169 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 
150 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  73.94 
 
 
150 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 
150 aa  229  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 
169 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  73.94 
 
 
150 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  73.24 
 
 
169 aa  229  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  75.69 
 
 
154 aa  228  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  73.61 
 
 
147 aa  227  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  72.54 
 
 
150 aa  227  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  72.54 
 
 
150 aa  226  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  72.54 
 
 
150 aa  226  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  72.54 
 
 
150 aa  226  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  72.54 
 
 
146 aa  226  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  61.27 
 
 
150 aa  186  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  46.85 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  51.37 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  45.14 
 
 
173 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 
164 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  48.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 
170 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
152 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  49.64 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  43.84 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 
161 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 
192 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
171 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
161 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  44.6 
 
 
157 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  45.9 
 
 
127 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  45.71 
 
 
148 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
147 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  45.52 
 
 
160 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 
163 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
170 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
174 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
161 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  30.22 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  30.83 
 
 
365 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  30.83 
 
 
365 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.81 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  29.32 
 
 
365 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  29.17 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  28.77 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  28.47 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
145 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 
146 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  43.14 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  41.18 
 
 
194 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  30.77 
 
 
383 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.34 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  30 
 
 
139 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  41.18 
 
 
172 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.04 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.04 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3349  MutT/nudix family protein  42.59 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
197 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>