More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4976 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 
142 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
130 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  40.34 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  39.5 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
525 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
133 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
137 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
166 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
138 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  29.6 
 
 
158 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
137 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.37 
 
 
136 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  33.91 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  32.77 
 
 
154 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
151 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  54.17 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  35.83 
 
 
167 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.56 
 
 
170 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3887  dinucleoside polyphosphate hydrolase  57.78 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144161  normal  0.0314277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  32.33 
 
 
399 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
298 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  48.15 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  51.85 
 
 
163 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  31.93 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  65.91 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
137 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
137 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
140 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
147 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  31.93 
 
 
154 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.81 
 
 
175 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  50 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0451  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.9 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  57.5 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 
132 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  26.03 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0412  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.16 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.309928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0166  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.77 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  26.03 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  45.12 
 
 
293 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  26.32 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  26.32 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  50 
 
 
148 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 
149 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0527  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.16 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.741334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 
149 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  42.86 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
141 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 
154 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
141 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0260  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.62 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  45 
 
 
133 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
140 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  32.52 
 
 
154 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  25.6 
 
 
136 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0564  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.33 
 
 
167 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  45.59 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  43.75 
 
 
153 aa  48.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
281 aa  48.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  46.15 
 
 
141 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
169 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
153 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
291 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  37.97 
 
 
156 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  32.33 
 
 
128 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  50 
 
 
329 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.92 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  50 
 
 
329 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.33 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2059  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.47 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  50 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.92 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.92 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>