211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0451 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0451  dinucleoside polyphosphate hydrolase  100 
 
 
170 aa  350  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0527  dinucleoside polyphosphate hydrolase  83.83 
 
 
179 aa  296  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.741334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0166  dinucleoside polyphosphate hydrolase  79.04 
 
 
168 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  79.39 
 
 
175 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0564  dinucleoside polyphosphate hydrolase  79.64 
 
 
167 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0412  dinucleoside polyphosphate hydrolase  79.64 
 
 
168 aa  277  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.309928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0260  dinucleoside polyphosphate hydrolase  78.44 
 
 
167 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  58.18 
 
 
172 aa  204  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4735  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 
182 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000037989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4225  NUDIX hydrolase  62.03 
 
 
186 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  0.0214287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.42 
 
 
171 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.96666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 
179 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2930  NUDIX hydrolase  57.59 
 
 
167 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.36611  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  54.82 
 
 
175 aa  190  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3887  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.94 
 
 
177 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144161  normal  0.0314277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.35 
 
 
177 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2559  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 
195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.599331  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2284  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151549  normal  0.0451993 
 
 
-
 
NC_004310  BR1836  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.69 
 
 
182 aa  177  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1769  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.38 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2241  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 
202 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0585336  normal  0.241237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.82 
 
 
175 aa  174  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  51.83 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1470  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 
175 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.37 
 
 
170 aa  153  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 
168 aa  150  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50.63 
 
 
162 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  49.38 
 
 
162 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50.63 
 
 
162 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50 
 
 
163 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.45 
 
 
164 aa  147  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  50.62 
 
 
161 aa  147  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.12 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 
160 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
158 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.12 
 
 
162 aa  141  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.91 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.71 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.65 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
158 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.38 
 
 
164 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.59 
 
 
170 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.49 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
167 aa  111  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2123  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.35 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0183314  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.75 
 
 
199 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.41 
 
 
176 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.41 
 
 
176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.41 
 
 
176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.41 
 
 
176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.41 
 
 
176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.41 
 
 
176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.8 
 
 
172 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0645  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.58 
 
 
182 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000308205  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.67 
 
 
235 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
197 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4213  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.42 
 
 
223 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.94 
 
 
199 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0834  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.31 
 
 
239 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.496439  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0774  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.77 
 
 
229 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.88 
 
 
177 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.74 
 
 
175 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1142  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 
175 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0845  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.77 
 
 
229 aa  101  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.206164  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.25 
 
 
175 aa  101  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.67 
 
 
226 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017529  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.88 
 
 
178 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  37.97 
 
 
173 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.97 
 
 
172 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.34 
 
 
193 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2817  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.08 
 
 
238 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0131722  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.48 
 
 
203 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.67 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00110033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5482  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.67 
 
 
229 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540126  normal  0.57899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3062  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.8 
 
 
235 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294815  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2652  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.8 
 
 
235 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.13 
 
 
221 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0104  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.67 
 
 
214 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.640787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>