More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4365 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  97.16 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  82.86 
 
 		 140 aa  240  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  82.86 
 
 		 140 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  59.65 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  55.74 
 
 		 183 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  55.46 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  52.1 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  48.25 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 203 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  45.05 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  43.69 
 
 		 758 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  43.84 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 269 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  29.37 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  29.37 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14570  ADP-ribose pyrophosphatase  36.19 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  0.156017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 228 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 173 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  36.17 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 303 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  34.57 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  32.76 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  29.52 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  28.97 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  41.67 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  36.47 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>