85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2667 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  34 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  31.52 
 
 
158 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  31 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  31 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
140 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  29 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  29 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  29 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  47.17 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.52 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  63.64 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 
183 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  65.62 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  32.56 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  32.56 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  50 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  51.16 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32.56 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  50 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  60.61 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
120 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  50 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
238 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
137 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
160 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.93 
 
 
315 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
238 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  36.07 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  33 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.56 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1955  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  60 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  45.45 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  60 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  51.35 
 
 
209 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1697  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0101183  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  38.46 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  51.43 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  52.63 
 
 
184 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
221 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
221 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 
122 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 
122 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  54.29 
 
 
159 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>