143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5170 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 124 aa  253  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  75.41 
 
 		 165 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  56.45 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  49.56 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 		 203 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  44.44 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  46.9 
 
 		 132 aa  93.2  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  41.23 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 185 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  39.58 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  34.29 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  36.54 
 
 		 758 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.84 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  31.36 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  38.6 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1955  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  31.53 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  29.27 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  29.27 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 152 aa  43.5  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  31.34 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  34.25 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  25.19 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  25.19 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  29.81 
 
 		 140 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 160 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 190 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 205 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>