254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1370 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  292  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  52.71 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
136 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 
144 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  47.66 
 
 
136 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  45.97 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
154 aa  104  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
139 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
142 aa  100  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  44.53 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  39.26 
 
 
399 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  43.55 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  40 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  42.19 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
149 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
398 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  35.38 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  41.74 
 
 
354 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  43.27 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  43.27 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  38.18 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
316 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  33.81 
 
 
313 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.18 
 
 
160 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  35.29 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  35.29 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.44 
 
 
318 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  28.89 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  31.48 
 
 
316 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  31.73 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  32.33 
 
 
347 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  32.48 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  30 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  47.37 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  32.61 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.31 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  28.15 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  33.7 
 
 
314 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  30.88 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
361 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  34.78 
 
 
314 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  45.9 
 
 
314 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  27.69 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2524  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
192 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.736999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  32.71 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  33.7 
 
 
314 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  29.36 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
334 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
167 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  43.75 
 
 
320 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  27.41 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.75 
 
 
320 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  30.15 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
135 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  31.62 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  27.41 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  27.41 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  27.41 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  35.87 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  35.87 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  35.87 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>