57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0617 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  45.13 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  41.41 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  40.2 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  34.86 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  34.86 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  32.99 
 
 		 399 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  36.52 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  36.52 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0577  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  23.21 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  23.21 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  34.26 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  30.7 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  36.47 
 
 		 354 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.45 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 153 aa  40  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>