191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1657 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  92.11 
 
 
152 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  67.97 
 
 
129 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
159 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
136 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 
134 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
398 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
139 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  47.33 
 
 
136 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  43.51 
 
 
399 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  50 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  41.22 
 
 
136 aa  87  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  40.74 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  43.52 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  43.52 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  50 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  33.07 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  34.78 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  36.54 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  34.86 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  35.79 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  35.11 
 
 
347 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  28.57 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.31 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  41.07 
 
 
524 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  30.83 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.33 
 
 
132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  45 
 
 
148 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
156 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.33 
 
 
132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  35.62 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  48.44 
 
 
320 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
386 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  31.19 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  31.58 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.53 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
218 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
334 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  31.11 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  45.61 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  46.55 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  45.61 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  29.69 
 
 
315 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.53 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  46.43 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  28.39 
 
 
325 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  27.73 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.53 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.14 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>