206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1495 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  100 
 
 
149 aa  290  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  74.5 
 
 
149 aa  197  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  50 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 
137 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 
139 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 
137 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
144 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 
136 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  47.06 
 
 
399 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  45.99 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
141 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  48.53 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
398 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  43.38 
 
 
354 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 
154 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  40 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  46.15 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  47.41 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  40.58 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  40.58 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  46.81 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  34.38 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
140 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
134 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  37.84 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  34.03 
 
 
310 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
291 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  46.77 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  28 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  28 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
160 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
159 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  37.6 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  37.9 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.81 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.83 
 
 
313 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  37.23 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  25.17 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  46.77 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  52.63 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  52.63 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  25.66 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  52.63 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  52.63 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  52.63 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  52.63 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
296 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34.53 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
198 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34.53 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  49.21 
 
 
314 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
143 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  52.63 
 
 
334 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  43.75 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  26.72 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  26.72 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  50.85 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  36 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 
473 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>