245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3934 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  100 
 
 
139 aa  273  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  45.97 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
136 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  50 
 
 
134 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  47.17 
 
 
399 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  46.15 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  44.72 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  45.86 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  41.61 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  43.38 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
398 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  39.25 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  39.25 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  40.15 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  33.06 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.62 
 
 
319 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  43.48 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  36.19 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  33.61 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.09 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.82 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  47.69 
 
 
318 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  45 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.01 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
334 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
153 aa  48.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34.65 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.04 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  45.71 
 
 
314 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  45.71 
 
 
314 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
167 aa  47  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
155 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
130 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  49.15 
 
 
313 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  31.34 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  26.45 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  38.98 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  35.51 
 
 
316 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  40 
 
 
329 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  44.29 
 
 
322 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  44.29 
 
 
314 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  29.55 
 
 
321 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  30.91 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.4 
 
 
347 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.61 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.75 
 
 
317 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  38.1 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.29 
 
 
314 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  36.84 
 
 
315 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.67 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.99 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  26.67 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  37.11 
 
 
302 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  31.54 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.76 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>