81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4195 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  55 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  48.84 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  40.62 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  37.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  39.13 
 
 		 399 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  36.21 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  39.58 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  36.21 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0577  hypothetical protein  45.45 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 175 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.58 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  32.61 
 
 		 129 aa  42  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  32.61 
 
 		 129 aa  42  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 137 aa  42  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0103  MutT/nudix family protein  30.65 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  49.02 
 
 		 141 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 		 146 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  36.17 
 
 		 354 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  32.5 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  49.18 
 
 		 383 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  31.76 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  26.04 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  48.98 
 
 		 320 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 142 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 141 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>