107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5229 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  34.96 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  38.82 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  36.79 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  31.43 
 
 		 399 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  30.63 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  29.69 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.98 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  38.36 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  38.36 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  28.91 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  44.83 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  30.37 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  34.71 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  34.71 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  29.91 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  35.44 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  31.9 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  29.32 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  29.32 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0103  MutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0415  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 128 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 149 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.67 
 
 		 132 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 142 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  47.73 
 
 		 143 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 134 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.31 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>