74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1773 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  74.5 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  44.78 
 
 		 399 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 398 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  48.25 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  38.81 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  47.5 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  44.78 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  49.45 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  43.24 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  43.24 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  35.46 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  45.74 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  38.14 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  36.56 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  44.78 
 
 		 314 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  39.47 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  48.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  32.1 
 
 		 399 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  39.39 
 
 		 134 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4733  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  33.04 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  27.05 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  36.67 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2477  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000509657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  28.46 
 
 		 305 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1874  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00903017  hitchhiker  0.00000719314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2590  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  normal  0.0536923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>