196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2521 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  100 
 
 
132 aa  266  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
136 aa  167  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  52.85 
 
 
133 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  52.34 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  44.19 
 
 
141 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
137 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  40.31 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
140 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  48.65 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  41.3 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  40.22 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  40.22 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
398 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  35.92 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0577  hypothetical protein  52 
 
 
51 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  32.33 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  32 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  32 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  34.31 
 
 
354 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  34.09 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  37.04 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  37.04 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  49.09 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  45.16 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
145 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  46.77 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  31 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  28.83 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  36 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  32 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
200 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  29.81 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.05 
 
 
570 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  30.36 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  30.19 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.19 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  32.2 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  36.67 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  31.03 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  31.96 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
170 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  31.43 
 
 
386 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  41.82 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  26.15 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>