214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3058 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  100 
 
 
134 aa  266  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  49.21 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 
136 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  50 
 
 
139 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  47.5 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
137 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  52.43 
 
 
399 aa  98.2  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  46.67 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
137 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  39.25 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  47.41 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  47.41 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  39.55 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  40.15 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  41.67 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
398 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  44.34 
 
 
354 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  42.28 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  39.36 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  34.43 
 
 
315 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.44 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  35.54 
 
 
163 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  31.3 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.65 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.51 
 
 
313 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  33.64 
 
 
320 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  47.46 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  33.64 
 
 
320 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  35.65 
 
 
310 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2470  hypothetical protein  29 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2328  hypothetical protein  29 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  32.43 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  33.91 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44.62 
 
 
314 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  30.53 
 
 
347 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  30.91 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.19 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  32.71 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.19 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.59 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.62 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  43.08 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  32.43 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  32.11 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  32.43 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  44.64 
 
 
314 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  32.43 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  35.14 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>