209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
130 aa  262  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  55.81 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
140 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
134 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
138 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  44.44 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  42 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  29.37 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  35 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
398 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  35 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  36.46 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  39.42 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  35.79 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  34.55 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  34.55 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  35.51 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.88 
 
 
318 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  35.48 
 
 
302 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  34.68 
 
 
320 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.98 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  34.96 
 
 
320 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  43.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  41.51 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  27.27 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
151 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  41.51 
 
 
148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  41.51 
 
 
148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.33 
 
 
360 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  37.17 
 
 
329 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.68 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  37.17 
 
 
329 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.31 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.62 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.62 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.62 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_007106  pE33L80004  phosphohydrolase, MutT/Nudix family protein  31.73 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.45 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  31 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.45 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  29.67 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
205 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.96 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 
205 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.52 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>