230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0214 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  48.48 
 
 		 399 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  43.31 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 		 398 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  41.94 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  46.27 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  45.19 
 
 		 354 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  38.1 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  41.07 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  41.07 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  32.52 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  38.53 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  35.64 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.11 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  38.32 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.51 
 
 		 360 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  37.5 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  27.18 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  33.85 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  29.92 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  55 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  32.2 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2689  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.392631  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2244  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000175605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2114  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0285  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>