More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5733 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  100 
 
 
218 aa  423  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  69.68 
 
 
230 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  53.64 
 
 
156 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  58.17 
 
 
157 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  44.37 
 
 
162 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 
167 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  43.85 
 
 
175 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  42.38 
 
 
175 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
169 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
169 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 
157 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  45.98 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  49.02 
 
 
160 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  29.41 
 
 
163 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
184 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
383 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  26.36 
 
 
170 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  32.14 
 
 
164 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  38.2 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
157 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  38.57 
 
 
135 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  35.51 
 
 
168 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 
156 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
143 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
135 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
144 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  42.42 
 
 
160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  42.42 
 
 
160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  38.36 
 
 
140 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
177 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
145 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
145 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
168 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
155 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.74 
 
 
138 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
155 aa  51.6  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
142 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.74 
 
 
138 aa  51.6  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  37.8 
 
 
140 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  34.58 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  34.58 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  34.58 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  34.58 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  39.47 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5063  mutT/nudix family protein  34.58 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  43.64 
 
 
430 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4746  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  34.58 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  43.75 
 
 
160 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
166 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
135 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
135 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  37.14 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
134 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.97 
 
 
142 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  45.45 
 
 
258 aa  49.3  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  41.54 
 
 
141 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
147 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
126 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
145 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
166 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.97 
 
 
137 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  40.79 
 
 
140 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  40.79 
 
 
140 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.14 
 
 
135 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  40.79 
 
 
140 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
163 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
154 aa  48.9  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
156 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
441 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  40.79 
 
 
140 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
156 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
171 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  40.79 
 
 
140 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 
175 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
154 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
153 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>