More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1805 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  98.85 
 
 		 441 aa  345  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  88.83 
 
 		 179 aa  315  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  71.78 
 
 		 169 aa  225  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  74.23 
 
 		 169 aa  220  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 456 aa  214  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  32.21 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  31.01 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  25.36 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 347 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  33 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  31.39 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 252 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  39.39 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  31.52 
 
 		 363 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.08 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.18 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  45 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  27.43 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.46 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 341 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.65 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4218  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  43.28 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  30.92 
 
 		 351 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  28.76 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  30 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  43.28 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40.62 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  41.94 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  36.99 
 
 		 334 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  27.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  36.99 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  43.75 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  36.99 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  36.99 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  36.99 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.36 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.35 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>