218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1525 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  88.83 
 
 		 174 aa  315  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  87.71 
 
 		 441 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  73.86 
 
 		 169 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  75.89 
 
 		 169 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 		 456 aa  210  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 159 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  32.88 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  29.49 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  28.4 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 218 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  38.57 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.16 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  30.09 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  30.97 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  35 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 341 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35.35 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 377 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.39 
 
 		 360 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  36.25 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  31.87 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0998  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.66 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 347 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  40.74 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  39.06 
 
 		 334 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.03 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 305 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4218  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 340 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  35.66 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.66 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  43.28 
 
 		 329 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 131 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  43.28 
 
 		 329 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  34.88 
 
 		 315 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  38.89 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  39.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.77 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  39.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  39.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  39.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  39.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.46 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  41.94 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>