More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 163 aa  322  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  42.18 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  46.08 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  36.43 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  39.51 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  39.13 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  42.11 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  27.12 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  27.97 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  44.9 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  32.31 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  30.09 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  31.52 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  35.35 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 200 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  29.52 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 		 141 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 		 386 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 465 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 322 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  31.45 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  50 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  34.38 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  35.82 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 351 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  35.09 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  24.14 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  35.59 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  37.29 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  32.23 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  24.14 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 298 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  35 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>