More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3754 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  96.61 
 
 		 129 aa  230  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  43.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  36.08 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.11 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  30.28 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 145 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  32.67 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  34.23 
 
 		 318 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  53.66 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40.74 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.74 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  40.35 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35.11 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40.35 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  40.35 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  45.76 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  38.96 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.37 
 
 		 396 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.91 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  40 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>